Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SALL3Q9BXA9 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SALL3Q9BXA9 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SALL3Q9BXA9 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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