Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
VAT1Q99536 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
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VAT1Q99536 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
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VAT1Q99536 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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VAT1Q99536 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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VAT1Q99536 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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