Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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