Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CDO1Q16878 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CDO1Q16878 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CDO1Q16878 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CDO1Q16878 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDO1Q16878 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDO1Q16878 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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