Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPROQ16827 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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