Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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