Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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