Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.8 ms