Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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