Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNCBQ16143 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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SNCBQ16143 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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SNCBQ16143 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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