Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
USF2Q15853 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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