Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms