Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SEC23AQ15436 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SEC23AQ15436 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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