Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HERPUD1Q15011 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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