Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
MDC1Q14676 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MDC1Q14676 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms