Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD9Q14511 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEDD9Q14511 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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