Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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