Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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