Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SPTAN1Q13813 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SPTAN1Q13813 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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