Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
APOFQ13790 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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