Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
NEUROD1Q13562 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms