Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRPF4BQ13523 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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