Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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TUBB3Q13509 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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TUBB3Q13509 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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TUBB3Q13509 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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