Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ATMQ13315 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATMQ13315 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATMQ13315 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
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