Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SKP2Q13309 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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SKP2Q13309 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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SKP2Q13309 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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SKP2Q13309 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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SKP2Q13309 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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SKP2Q13309 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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SKP2Q13309 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SKP2Q13309 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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