Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GRIN2BQ13224 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms