Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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ERCC8Q13216 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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ERCC8Q13216 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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ERCC8Q13216 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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ERCC8Q13216 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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ERCC8Q13216 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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ERCC8Q13216 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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ERCC8Q13216 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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ERCC8Q13216 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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