Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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