Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CALCOCO2Q13137 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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