Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHAF1AQ13111 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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