Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRDNQ13061 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRDNQ13061 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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