Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNTN1Q12860 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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