Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NFIAQ12857 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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NFIAQ12857 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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NFIAQ12857 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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