Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPFP49454 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPFP49454 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPFP49454 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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CENPFP49454 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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CENPFP49454 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
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CENPFP49454 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
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CENPFP49454 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
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CENPFP49454 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPFP49454 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPFP49454 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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CENPFP49454 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPFP49454 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPFP49454 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPFP49454 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPFP49454 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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CENPFP49454 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPFP49454 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
CENPFP49454 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
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