Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
HOXD11P31277 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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