Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CTIFO43310 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CTIFO43310 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CTIFO43310 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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