Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
UBXN8O00124 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
UBXN8O00124 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms