Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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