Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP18Q9UMW8 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP18Q9UMW8 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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