Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SH3BP4Q9P0V3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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