Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
GDE1Q9NZC3 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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