Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LHX9Q9NQ69 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LHX9Q9NQ69 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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