Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms