Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SLC46A3Q7Z3Q1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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