Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFT2D3Q587I9 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SFT2D3Q587I9 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms