Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
MSMPQ1L6U9 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms