Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC142Q17RM4 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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