Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
LAMA3Q16787 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms