Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FSCN1Q16658 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FSCN1Q16658 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FSCN1Q16658 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
FSCN1Q16658 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FSCN1Q16658 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FSCN1Q16658 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms