Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNGA3Q16281 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms