Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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NEDD8Q15843 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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NEDD8Q15843 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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NEDD8Q15843 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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NEDD8Q15843 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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NEDD8Q15843 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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NEDD8Q15843 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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NEDD8Q15843 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NEDD8Q15843 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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